Sotto il pavimento di una grande casa situata in un magico giardino alla periferia di Tokyo, vive arrietty, una minuscola ragazza di 14 anni, con i suoi altrettànto minuscoli genitori. La casa è abitata da due vecchiette, che ignorano la presenza di questa famiglia. Un giorno Sho, un ragazzo di 12 anni che deve sottoporsi a cure mediche, si trasferisce nella casa. I genitori di arrietty le hanno sempre raccomandato di non farsi vedere dagli umani, ma la ragazzina non li ascolta e Sho si accorge della sua presenza. I due iniziano a confidarsi e in breve tempo nasce un'amicizia...