Una spedizione perlustra le acque delle Everglades in Florida per ritrovare il mostro della laguna nera che lì era scomparso al termine de La vendetta del mostro. Fanno parte della spedizione il dottor William Barton, sua moglie Marcia, il dottor Thomas Morgan (Rex Reason) e una guida, Jed Grant. Trovato e catturato, Barton ha delle idee particolari sul mostro, volendo compiere crudeli esperimenti per trasformarlo in un essere capace di respirare fuori dall'acqua. Modificato, il mostro è confinato in una prigione dalla quale può vedere il mare da cui è stato allontanato per sempre. Ma ha ancora la forza di ribellarsi.