Naruto sta per catturare il malvagio Ninja Mukade quando quest'ultimo, evocando il potere delle Linee Temporali, riesce a spedire indietro nel tempo Naruto, precisamente nella città di Loran, conosciuta per le sue mille torri. Lì incontra il futuro Quarto Hokage, Minato Namikaze, in una missione top-secret e la Regina di Loran, Sara, il cui governo è minacciato da Mukade. Riuscirà Naruto a tornare nel suo tempo e può un incontro casuale nel passato salvare il futuro?