Claudia Mares, vice questore della mobile di Roma, viene richiamata a Palermo per guidare la nuova operazione della "Duomo", la squadra antimafia che rese possibile l'arresto di Bernardo Provenzano. Tra gli "scappati" che tornano a Palermo dopo anni di latitanza in america e le famiglie più importanti della mafia siciliana che combattono per la conquista e la spartizione dei territori lasciati scoperti dalla cattura dell' "ultimo padrino", gli uomini della squadra scopriranno che il tempo dei pizzini è finito e che è nata quella che viene definita la "mafia moderna".