Flynn, un programmatore di video giochi, è stato derubato delle sue invenzioni dalla potente impresa per cui lavorava. Per raccogliere le prove del furto, con l'aiuto di due amici, vuole penetrare nel sistema dell'azienda, gestito da un gigantesco elaboratore elettronico. I tre vengono disintegrati e trasportati all'interno di programmi che rispecchiano i propri creatori e dovranno combattere una lottà senza tregua contro il cervello elettronico.