Sono passati ormai due anni da quando Cloud ha lottato e vinto per salvare l'umanità. Ma il mondo sta per affrontare una nuova minaccia. Un male misterioso si sta diffondendo a macchia d'olio. Vecchi nemici si preparano alla riscossa. E Cloud che ha abbandonato le vesti di eroe per una vita solitaria, è costretto nuovamente a combattere.