Le mystère du harem, c'est l'histoire d'une jeune fille qui émigre en Algérie avec ses parents au début de la colonisation française en 1830. Elle sera capturée avec ses parents par une tribu en Algérie et offerte par Abd-el-Kader au sultan du Maroc. Le fils de ce sultan tombera amoureux de cette jeune fille captive alors enfermée dans le harem de Marrakech.
Le harem est un lieu clos, avec ses codes, et ses mœurs, c'est le monde des concubines, des esclaves, des eunuques, un monde ou règne le despotisme, un endroit fait pour les plaisirs du maître des lieux....C'est aussi un monde sans pitié ou des intrigues se créent pour parvenir à la position de favorite auprès du sultan. Les crimes ne sont pas chose rare pour y arriver...